JOJO的奇妙冒险一共有五部：
1.《JOJO的奇妙冒险》故事的一个开端发生在19世纪后叶，讲述了乔纳森·乔斯达（大乔）与迪奥·布兰度（dio）之间的故事。在dio获得了石面鬼能力后，毁掉了大乔的一切后大乔遇见了齐贝林跟其学习了波纹能力，后面在去讨伐dio的路上牺牲并把自己最后的波纹传给了大乔，大乔也在跟dio的决战的时候同归于尽了。这里为后面埋下了伏笔!
2.《JOJO的奇妙冒险 星尘斗士》在二十世纪三、四十年代的纽约，二乔遇上了新的敌人，史前生物柱之男。柱之男是创造吸血鬼的元凶。为了能打败柱之男，二乔和西撒一起寻找莉莎莉莎进行波纹气功的特训。 后战斗中西撒死亡。在第二部里不仅有大家喜欢的龙舌兰姑娘，还展示了德意志科技的强大以及修特罗海姆在没有波纹的情况下视死与柱之男对抗的精神。最终最后的柱之男卡滋被维苏威火山爆发的威力送入了太空。二乔也因此失去了一只手。
3.《JOJO的奇妙冒险 星尘斗士埃及篇》讲述了替身，是一种新的能力。反派就是第一部的伏笔dio，失去身体的dio占用了大乔的身体重生获得了世界替身，在乔斯达家的宿敌dio复活的影响下，空条承太郎也获得了替身能力。为了拯救因迪奥的诅咒而倒下的母亲，空条承太郎与外祖父·乔瑟夫以及伙伴们一起为了打倒迪奥而展开旅程。在旅程途中产生了著名的梗——典明粥（一种特别好吃的东西），随后承太郎与dio决战也学会了世界的能力，打败了反派dio。
4.《JOJO的奇妙冒险 不灭钻石》在埃及与宿敌 DIO的死斗之后过了11年。1999年，空条承太郎为了调查一张图片的秘密与东方仗助见面，来到了杜王町。仗助也拥有与承太郎相同的特殊能力“替身”。展开了故事，其中引出了一个神秘的武器“虫箭”这是一个能让人获得替身能力的武器。在主角团查出反派后，反派吉良吉影父亲为保证儿子安全制造出许多替身使者，但凭借仗助替身能力主角团无一人死亡。经过一番决战后反派吉良吉影被jo护车给“带走了”。
5.《JOJO的奇妙冒险 黄金之风》讲述了住在意大利那不勒斯的青年乔鲁诺·乔巴纳，继承dio血脉。幼年时遭受迫害自暴自弃的他，被一名黑帮男子拯救，而学到了相信他人、不忘恩义、让他的心变得率直。就这样，乔鲁诺决定成为黑帮明星，在遇见布加拉提后就有了实现梦想的机会，（此处阿帕茶诞生）一步一步的靠近老板，想要打败老板，占领城镇。在于老板几次交战后乔鲁诺通过虫箭提升了替身能力，让老板陷入了死亡循环状态，最后完成了自己的梦想，成为了秧歌star