1. 琴酒纯黑
【那位先生】
黑衣组织的首领。被组织成员呼为“那位先生”，除此之外一切信息不明。
朗姆Rum
黑衣组织的二号人物，Boss的心腹。性别及外貌均不明，装有一只义眼，真实身份在黑田兵卫、若狭留美、胁田兼则三人之中。
【琴酒（Gin）】黑衣组织的干部。冷酷残忍，头脑冷静，似乎可以毫不犹豫地杀死任何人。给新一灌下毒药使其身体变小的罪魁祸首。
【伏特加】 经常跟随在琴酒身边的黑衣组织成员。
【贝尔摩得（苦艾酒）】 真实身份为美国的大明星莎朗·温亚德，诈死后将身份转换为自己的女儿克莉丝。曾经试图追杀叛离组织的雪莉（灰原哀）。精于变装。由于在纽约受过新一和小兰的救命之恩，因此一直刻意保护两人。
【基安蒂】 组织的狙击手。很讨厌苦艾酒。
【科恩】 组织的狙击手。
【龙舌兰】 身材高大的关西大汉。后来被卷入某起案件而被炸死。
【匹斯可】 本名枡山宪三。曾经一度掌握了雪莉的所在，但后来由于射杀吞口议员的画面被拍下，而遭琴酒灭口。
【宫野明美】 宫野志保（灰原哀）的姐姐。组织的基层人员，为了让自己和妹妹脱离组织而参与了10亿元抢劫，但后来组织却出尔反尔，明美也被琴酒所杀。曾经和潜入组织卧底的赤井秀一交往。
【宫野厚司】 科学家，明美和志保的父亲。由于不明原因死亡。
【宫野爱琳娜】 明美和志保的母亲。由于不明原因死亡。
要说灰原哀（宫野志保，代号雪莉Sherry）也算成员一个，现在论剧情应该不算了。
波本（Bourbon）：
本名降谷零，化名安室透。真实身份为日本公安警察派入黑衣组织的卧底，组织代号“波本”（Bourbon）。表面职业为私家侦探、餐厅服务生，在毛利侦探事务所楼下的波洛咖啡厅打工，并拜毛利小五郎为师。
基尔Kir
CIA卧底，真名本堂瑛海，化名水无怜奈，曾被FBI误擒，现已回到组织继续任务。
卡尔瓦多斯Calvados（死亡）
黑衣组织中的狙击手。持各种武器，最喜欢用霰弹枪和狙击枪。因迷恋贝尔摩德而参与到贝尔摩德与FBI的对决中，被赤井秀一打断双腿，在被带走调查前自杀身亡。
爱尔兰 Irish（死亡）
剧场版第13弹《漆黑的追踪者》中登场。他发现了柯南的真正身份，任务失败后，以自己的生命保护柯南，被基安蒂枪杀。
库拉索Curacao（脱离组织）
黑衣组织二号人物的心腹，《纯黑的噩梦》中的主要角色之一。黑衣组织的重要成员，拥有双色瞳（虹膜异色症），左眼蓝色，右眼透明（虹膜与巩膜颜色相近），具有超强的记忆能力，失忆后偶遇少年侦探团，恢复记忆后背叛了组织，目前生死待定。
2. 琴酒纯黑文
1.黑麦威士忌
这位想必大家都很熟悉了，帅气的FBI搜查官赤井秀一。曾打入组织内部，代号“黑麦威士忌”。被组织内部称为“银色子弹”。狙击能力一流，至今还没有发现能与之抗衡的。现以冲矢昴的身份住在新一家。
2.波本
这一位和上一位是死对头了。本名降谷零，化名安室透。真实身份是日本公安警察。潜入组织内部，组织代号波本。也是一个有极强观察力和推理能力的人，和上一位一样都是大帅哥。
3.苏格兰威士忌
上两位的恩怨就是因为这一位。他与安室透同为日本公安警察派入组织的卧底。后因身份被发现，自杀。而安室透却误认为是赤井秀一杀了他，因此与秀一结怨。
4.雪莉
原名宫野志保，在组织里代号为雪莉。是APTX4869的研制者。因姐姐宫野明美被组织杀害，于是与组织反抗。被囚禁后，喝下了APTX4869，变成了小孩。化名为灰原哀住在阿笠博士家。
5.宫野明美
宫野志保的姐姐，秀一的前女友。因想带着妹妹脱离组织，答应组织完成抢劫十亿日元的任务，之后却被琴酒杀害。是一个很善良的女生。
6.基尔
真名为本堂瑛海。真实身份是CIA派入黑衣组织进行卧底调查的谍报员，组织代号"基尔"。后因受到FBI帮助，答应向FBI提供情报，条件是FBI需对自己的弟弟本堂瑛佑进行保护。
7.库拉索
是剧场版《纯黑的噩梦》里的主要角色。是朗姆的心腹。入侵警视厅电脑盗得各国间谍名单后，被日本公安警察发现。逃离过程中，被赤井秀一击破轮胎，落入海中，失去记忆。之后得到少年侦探团的帮助，而被感动，背叛了组织。最后为了救人牺牲了。
8.爱尔兰
剧场版《漆黑的追踪者》中的主要人物。因琴酒杀死了自己如父亲般尊重的皮斯克，而讨厌琴酒。无意中发现了柯南的真实身份是工藤新一，向组织隐瞒了自己的发现。之后为保护柯南而死，在死前鼓励新一“无论如何，都要追下去”。
9.贝尔摩德
贝姐可谓是一个复杂性人物了。虽说没有背叛组织，但是知道柯南的真实身份却没有上报组织。认为柯南是可以摧毁组织的“银色子弹”，是很多柯迷眼中女神一般的存在。
3. 琴酒纯黑同人小说
24部，排名前十：
排名第一的就是：日本网友们最喜欢的《名侦探柯南》剧场版，毫无疑问就是《贝克街的亡灵》。看得出来，日本网友对于其他地区的地图比较感兴趣，比如《名侦探柯南：贝克街的亡灵》所采用的地图，就是19世纪的伦敦。另一方面来说，《贝克街的亡灵》故事比较精妙，像诺亚方舟、游戏之类的词汇，观众们还是比较感兴趣的。
第二的是：《零之执行人》主要讲述了安室透的故事，安室透的出场，确实给《零之执行人》带来了不不少的票房。关于神秘的黑衣组织，我们总是抱有着很大的期待。黑衣组织里面比较重要的角色，让我们印象深刻的角色，基本上都有隐藏的背景，除了“单纯”的琴酒之外。
3《纯黑的噩梦》
4《迷宫的十字路口》
5《瞳孔中的暗杀者》
在《瞳孔中的暗杀者》剧场版里，小兰被袭击而丧失了记忆，确实是一个不错的开场剧情。“失忆梗”永远不会过时，尤其是在《名侦探柯南》里，还是一个不错的设置悬念的方式。看得出来，对于《瞳孔中的暗杀者》这部分的剧情，还是有着很高热度的。最后的结局不算太重要，过程里的剧情才是最重要的。
6《唐红的恋歌》
7《绀青之拳》
8《通往天国的倒计时》
在这部剧场版里，出现了灰原哀和黑衣组织。由于《通往天国的倒计时》是2001年推出的剧场版，那个时候黑衣组织还是比较神秘，所以吸引了很多观众们的兴趣。后来，关于黑衣组织的秘密一点点揭晓，成员也一点点出现。
9《银翼的魔术师》
关于“银翼的魔术师”，不用说我们也知道他是谁。《名侦探柯南》和《怪盗基德》的串场，确实让我们非常期待。看到了《银翼的魔术师》剧场版之后，我们终于满足了心里的“联动”想法。柯南（工藤新一）终于有机会和基德（黑羽快斗）同款了，对于观众们和漫迷们来说，还是一件值得开心的事情。
10《异次元的狙击手》
险些被挤出去的剧场版，就是《异次元的狙击手》了。《异次元的狙击手》获得了第10名的成绩，还是很不错的。
说句实话，《名侦探柯南》每一部剧场版基本上都有着不低的票房，票房的高低可以看见《名侦探柯南》系列的精彩程度。归根结底，有两个比较重要的原因，一个原因是《名侦探柯南》本身就是经典动画，长时间的连载已经积累了很高的人气；另一个原因是，《名侦探柯南》确实十分精彩。
4. 琴酒4368
Apoptoxin 4869，在名侦探柯南中将工藤新一和宫野志保变小的药物，由宫野志保在黑衣组织期间制造出来的。 原名 APOTOXIN4869（アポトキシン4869），APTX-4869中的APTX是“Apotoxin”的缩写，由Apotosis（细胞程序性死亡）和toxin（毒素）所组合成的混成词。其设计刚开始曾在草稿阶段时使用福尔摩斯原本的名字(shelling ford)为其药物的名称；其含义为“残废的名侦探”。 此外，APTX-4869也是作者青山刚昌家中电脑的名字。 在TV400集心存疑惑的小兰，柯南的手机密码也是4869【小兰找出来的线索是‘夏洛克’】，琴酒也曾用4869作为车牌号（后改为4368）。
5. 琴酒纯黑小说
对，他们都加入过组织，
但赤井秀一被人发现是卧底了，所以琴酒一直想要解决他，直到赤井和水无合计在琴酒面前诈死，后易容伪装成冲矢昴。
而安室透还在组织里，代号波本，实际上公安部的卧底，在剧场版《纯黑的噩梦》里也曾被琴酒怀疑，但是后来在柯南的帮忙下，让琴酒暂时解除怀疑
6. 琴酒黑白
1.
我情愿在你的记忆里淡忘，也不愿你为我受伤。
——柯南
2.
喜欢你，因为我喜欢你，比世界上的任何一个人都喜欢你。
——柯南
3.
强者不一定是胜者，而胜者一定是强者。
——柯南
4.
我们会死很久，所以活着的时候一定要开心。
——服部平次
5.
等得越长久，重逢时也就更幸福。
——毛利兰
6.
正因为生命有限，所以才显得更重要，正因为生命有限，所以才更应该努力不懈。
——服部平次
7.
只要和你有关的任何事情我都不会忘记。
——柯南
8.
时间过得越久，人心的距离就越远。
——灰原哀
9.
夕阳，将世界像血一样染红了的，太阳的最终宿命，我还可以看多少次，这种悲哀的天色。
——灰原哀
10.
每次我最痛苦的时候，你总是能看透我的心，虽然很不甘心，但是我好高兴。
——毛利兰
11.
简直如同童话一般，当恶魔流下眼泪的同时，也就失去了魔力。
——灰原哀
12.
我再也不要看见她哭的样子了，就算我从此从她心目中消失。
——工藤新一
13.
像花那样的娇弱而不坚强，即使能够保持着外表躲避风雨，却依然恋着阳光。而且也会枯萎，暴风雨来临时无论多么华丽的外表都无法遮挡。
——灰原哀
14.
有些人不属于自己，但是遇见了也弥足珍贵。
——《名侦探柯南》
15.
决定人生的瞬间，不能对自己说谎。
——柯南
16.
世界上有些事，还是让它永远成为谜比较好。
——怪盗基德
17.
原谅我的不善言辞，只懂得一味的陪伴。
——《名侦探柯南》
18.
不要哭啊。因为，你哭的话，我也会不开心的。
——工藤新一
19.
都已经等了他十年，无所谓再等上十年。
——毛利兰
20.
在这个世界上，重要的不是你到底做了什么；更重要的是，你如何让别人完全相信你真的做了什么。
——《名侦探柯南》
21.
齿轮总有卡住的地方,如果勉强让它动起来,最终是要让一切都化为泡影,还是要从头来过,恢复正常,努力追回落后的部分,你只是害怕,害怕从头来过!
——柯南
22.
柯南君，对不起，不能陪你到最后。
——毛利兰
23.
——love就是0，无论如何叠加，都只会输的很惨。
——说love是0，别笑死人了，你去告诉草地女王，0是一切的开始，如果不从那里出发的话，什么都不会开始，什么也不会达成。
——工藤新一
24.
掌中之物，未必在掌握之中。
——诸伏高明
25.
我是不相信这个世界上是有上帝的。如果有的话，哪里还会有那么多的不幸，不幸的人和不幸的事。至少天使从没有对我笑过，一次也没有……
——贝尔摩德
26.
深海里的鲨鱼，看到海面上，阳光下跳跃的海豚，总会不自觉的害怕。
——灰原哀
27.
我不怕等待，因为等待的时间越长，等到之后就会越幸福呢。
——毛利兰
28.
你还是不知道，什么也不知道，不过我也不想让你知道。
——灰原哀
29.
或许，魔术的确是骗人的，但是，看魔术的人，喜欢被人骗。
——怪盗基德
30.
除去不可能的,不管多么不合情理,但那就是真相……
——柯南
31.
各位名侦探：
当兄弟之血染红北方后，
剑器的舞者映衬着帝国的辉煌。
——怪盗基德
32.
执着于复仇与憎恨，即使美好就在眼前，也会视而不见。
——柯南
33.
“爱”就是科学与逻辑永远无法解释的程序。
——灰原哀
34.
万年传说的西方，与我相似的高度，我将于无法缺少的漂碧上，取走属于我的守护。短暂的黑暗驱散光明，黑暗，永远是我的舞台。
—— 怪盗基德
35.
用推理把凶手逼到绝境，再眼睁睁看着凶手自杀的侦探，跟凶手又有什么两样。
——柯南
36.
因为人死之后，就只能活在别人的回忆中了…
——高木涉
37.
“快斗，你好像真正的基德哦”
“笨蛋，我可是比基德本人更帅的哦”
—— 怪盗基德&中森青子
38.
任何人都不该轻易相信，也不是所有人都不可信。请用眼看，用心感受，谁才是真心对你的人。
——怪盗基德
39.
说出的话是收不回来的，语言是把利刃，使用不当会成为可怕的凶器。因为一句话的差错可能会失去一生的挚友，一次擦肩而过可能就再也见不到了。
——柯南
40.
我，从小时候起就已喜欢上一个人，她性格刚强，很有主见，不会乱哭乱吵，是我心目中的女神。
——柯南
41.
黑色可以隐藏自己不想为人所知的一面。
——赤井秀一
42.
夕阳，把世界都染红的太阳的末日。不知我这一生还有几次，能看到这种悲伤的色彩。
——灰原哀
43.
花是纤弱而短命的，即使维护起来，它们依然因喜恋阳光而枯萎， 一旦暴风雨袭来，再金贵的栅栏也保护不了它们。
——灰原哀
44.
畏惧死亡比死亡更可怕。
——赤井秀一
45.
我早上照镜子的时候， 都会感到一股寒意，你到底是什么人？是谁？镜子能反映出所有真实的东西，但它却不能照出真正的你。你的正义之眼看得穿邪恶之心，却看不透女人的心意。
——灰原哀
46.
就像罐装饮料自动售货机，你投入钱它就会为你解渴，可是你不往里面投钱它就什么也不会提供给你靠钱是买不了人的心灵的。
——灰原哀
47.
在瞬间之下，明白所有真相，只要开始，就不会停止……
——《名侦探柯南》
48.
友情，恋爱，神秘，只因为有当初的约定才可以坚持到底……
——《名侦探柯南》
49.
隐藏树叶最好的地方是森林中……
——灰原哀
50.
We can be both of God and the devil.Since we're trying to raise the dead against the stream of time.
（我们既是上帝也是恶魔。因为我们要逆转时间的洪流，让人死而复生）
——苦艾酒
51.
虽然我不知道杀人的理由是什么，但是救人肯定是没有理由的！
——工藤新一
52.
你只是读了故事的开头简介，就以为能看透全部了么，这个世界比你想象的还要深奥，还要难以理解。
——黑羽道一
53.
真是不好意思，看来我的体内还是流着冷酷的黑色的血。
——灰原哀
54.
我会回来，就算拼死也会回来！
——柯南
55.
月亮不是为了吊丧死者，而是为了使真相更加明朗。
——柯南
56.
因为有你在……就是因为你也在那里，我才能够这样冷静，因为有和我遭遇一样情况的你也在那里。
——灰原哀
57.
为了一句“等我”而苦无止尽的等待那个人，最后他却连身影都无法出现…我不想再看到她伤心的泪水了，我在她的心目中永远消失也无所谓……
——柯南
58.
苹果是禁果。以前亚当和夏娃吃过后，就被逐出了伊甸园。所以它是“明辨是非的知识果实”。
——灰原哀
59.
这样不是很好吗？可以忘记一切，远走高飞，逃到一个听不见任何嘘声的，遥远的地方。
——灰原哀
60.
再见是分离的时候带来针刺一样痛苦的悲哀的言语……
——灰原哀
61.
如果我像玛丽皇后一样化作断头台上的露水的话，它会不会像她的爱犬迪比一样追随我投身于塞纳河里呢？
——灰原哀
62.
如果说怪盗是一个技艺精湛，盗取财宝的艺术家，那么侦探就只是跟在怪盗后面吹毛求疵，充其量不过是个评论家。
——怪盗基德
63.
勇气这个词 是形容人挺身而出的正义字眼，不能用来当作杀人的理由。
——毛利兰
64.
如果要伤害别人的感情才能实现的话，对那个人来说，梦想就已经不能称之为梦想了。
——毛利小五郎
65.
红尘有你是一种难能可贵的美丽，与你相遇更是我一生的幸运，有你相伴就是一种惟一的幸福。我爱你。
——柯南
66.
如果为了莫名的好奇心和正义感而犹豫的话，也许会失去一切的。
——灰原哀
67.
人与人的邂逅充满了神奇，各种刑案更是迷题重重，能够遇到你真是有缘……
——《名侦探柯南》
68.
隐藏的是心中的秘密，照耀两人的是star和snow……
——《名侦探柯南》
69.
除去假象之外，剩下的事情，无论你多么不愿意相信,那就是事实。
——灰原哀
70.
如果可以真实的让你毁灭，为了公众的利益，我很乐意迎接死亡！
——工藤新一
71.
正义……并不是随随便便挂在口边摆样子的东西……而是秘密的珍藏在自己心中的东西……
——佐藤警官
72.
伸出手去，抓不住流水，挽不住流年，一切都是徒然。
——《名侦探柯南》
73.
决定人生的那一瞬间，绝对不能够欺骗自己。
——《名侦探柯南》
74.
不管我怎么迷路，你都找到我的吧。
——毛利兰
75.
A secret makes a woman woman.（秘密让一个女人更有女人味）
——苦艾酒
76.
无论罪犯计划得多么周全，笑到最后的也不会是罪犯。
——服部平次
77.
背叛者是没有容身之处的。
——灰原哀
78.
Lady and gentleman! It is show time!
—— 怪盗基德
79.
黑的和黑的混在一起只能是黑的
—— 琴酒
80.
——“既然你是侦探，那你就推理一下我的心思啊！”
——“参杂了不该有的感情，就算是福尔摩斯也是无法推理的！”
——工藤新一&毛利兰
81.
钟楼之下，初次邂逅；变出玫瑰，请多指教；经常吵架，打打闹闹；喜欢快斗，讨厌基德；黑羽快斗，成为基德；高中时期，再次邂逅；以快为夫，以青为妻；以快之姓，冠青之名。
——怪盗基德
82.
其实我从小就有喜欢的对象，她个性强悍又很倔强，又很容易掉眼泪，是个很奇特的女孩子。
——工藤新一
83.
你知不知道我有多难过，你不在的时候我像个呆子一样一直念着你，而你却.........
——毛利兰
84.
在我坚定无比的内心里，永远以最坚强的节奏揭发案情……
——《名侦探柯南》
85.
正是因为对仇恨太过执着，才会错过美好的事物。
——《名侦探柯南》
86.
看来你的字典里也没有“不可能”这三个字，工藤。
——灰原哀
87.
人的心是用钱买不到的东西。
——《名侦探柯南》
88.
新一哥哥说，他说一定会回来的，就算死也会回来的。
——柯南
89.
三绝的画家灵魂在哭泣，
我将在祭奠先人哀思的第一天，
出现在人定的开始。
前往日不落的地方，
取走皇帝案头历经磨难的美人。
怪盗基德 上
—— 怪盗基德
90.
当太阳落山
时间倒转
岁月轮回
战士血洒战场
皇后左手持花痛哭
国王手拿大斧之时
魔术就开始了!
宙斯的继弟(还要解释谁发的和推理过程)
怪盗基德预告函狮子坠落的最后期限
Diana沉睡的所在
古老的光明之山
是我要得到的璀璨
怪盗基德 上
—— 怪盗基德
91.
在圆月最光辉的日子，堕落的天使降临的时刻，最近似神之人即将到来。他将去往那手足相残狼之子的领土，惩罚贪婪的人们拯救善良的人，带走那带来灾难的最坚硬希望之石。
怪盗基德 上
——怪盗基德
92.
狮子坠落的最后期限
Diana沉睡的所在
古老的光明之山
是我要得到的璀璨
怪盗基德 上
——怪盗基德
93.
狼狈逃难的众神之王
在宇宙最遥远的距离
邂逅了纷飞的斐波那契
我披着满天的星光
盗走月亮之女的骄傲
怪盗基德上
——怪盗基德
94.
怪物主宰天下之时
逆转时钟会回归起点
在美丽的黑白之乡
拜领残缺的女神
怪盗基德 上
——怪盗基德
95.
受到名为爱之毒的束缚
罪恶的人们在墙边叹息着月亮的焚毁之时
我将取走阁下的挚爱
怪盗基德上
——怪盗基德
96.
当凌晨（S ）1点半来临，我将手持女神的火炬，在白天Ray是没有用的，
她美丽的眼神注视着MOMA。
我将盗取一位名人（Abstraction）献于世人之作 nollyivA'D sellesiomeD seL （S）
怪盗基德上
——怪盗基德
97.
分裂的剪刺入大地
白衣罪人佩戴玫瑰
当魔术在历史上初演时
降临魔术舞台
怪盗基德 上
——怪盗基德
98.
漆黑夜色中银翼的华丽篇章,
魔术完美于十月的重喜,
漫天飞舞的血色与金星,
易生歧义的是胜利者的手势.
P.S.我将莅临这片包含历史的圣土;
飞翔于SH$@)的顶峰
怪盗基德 上
——怪盗基德
99.
蓝月下的黑夜，
钟声敲响前的最亮的明灯下，
婴儿与昙花的最后一刻，
我将打开潘多拉的盒子，
将“潘多拉的希望”重归于主！
怪盗基德 上
——怪盗基德
100.
四年轮回之际，
我将披着月晖，
伴着一天中最长的乐声降临约瑟芬的城堡带走悲伤的石头。
怪盗基德 上
——怪盗基德
101.
流动的水没有形状， 漂流的风找不到踪迹，任何案件的推理都取决于心，揭开唯一真相的，是外表看似小孩，智慧却过于强人的，名侦探柯南！ 无处不在，无事不晓，任何案件都能破解……一线线索即能解开。孩子们的偶像，大人们的帮手，名侦探柯南。
——青山冈昌